"Wir müssen an Orten, an denen sich die Infektionsketten größtenteils ausbreiten, was Parteien und leider auch Reisen sind, etwas strenger sein", sagte der Stabschef der Kanzlerin, Helge Braun, gegenüber dem öffentlich-rechtlichen Rundfunk ARD.
"Wir stehen am Beginn einer zweiten Welle und nur die Entschlossenheit der Politiker und der Bevölkerung wird entscheiden, ob wir sie vermeiden oder verlangsamen können", fügte er hinzu.
Deutschland hatte es geschafft, die Zahl der Neuinfektionen und Todesfälle niedriger zu halten als viele seiner Nachbarn, aber die tägliche Zahl der Neuerkrankungen ist seit Donnerstag über 4,000 gestiegen, der höchste seit April.
Die Zahl am Sonntag lag darunter, aber das liegt daran, dass die Testberichte am Wochenende tendenziell niedriger sind.
Merkel und Bürgermeister aus den elf größten Städten Deutschlands haben sich am Freitag (11. Oktober) darauf geeinigt, strengere Maßnahmen zu ergreifen, wenn Infektionen eine Schwelle von 9 Fällen pro 50 Einwohner pro Woche überschreiten.
Mittlerweile liegen mehr als 20 Städte über diesem Niveau, was zu einem Flickenteppich interner Reisebeschränkungen geführt hat.
Braun, ein Arzt, sagte, Testzentren sollten Arbeitern im Gesundheitssektor und Menschen, die Symptome zeigen, Vorrang vor Touristen einräumen.
Urlauber können die örtlichen Bordsteine umgehen, wenn sie negative Testergebnisse erzielen.
Der bayerische Ministerpräsident Markus Soeder schlug am Wochenende höhere Geldstrafen für Personen vor, die keine Masken tragen, wenn dies in öffentlichen Verkehrsmitteln und Geschäften vorgeschrieben ist, und zwar in Höhe von 250 Euro (295.60 US-Dollar) gegenüber derzeit 50 Euro und 500 Euro für Wiederholungstäter.
Braun sagte, er stimme mit harten Strafen überein.
Merkel wird am Mittwoch weitere Gespräche mit Ministerpräsidenten führen.